- Đánh giá được hiện trạng và dự báo biến động chất lượng môi trường vịnh Vũng Rô (Phú Yên).
- Đánh giá được khả năng tự làm sạch của vực nước và xác định được cơ chế tự làm sạch của một số chất gây ô nhiễm tại vịnh.
- Đề xuất được các giải pháp quản lý môi trường phục vụ khai thác, sử dụng có hiệu quả và phát triển bền vững kinh tế biển khu vực vịnh.

- Về khoa học: Kết quả đánh giá hiện trạng và dự báo biến động chất lượng môi trường vịnh Vũng Rô (Phú Yên), khả năng tự làm sạch của vực nước và đề xuất được các giải pháp quản lý môi trường phục vụ khai thác, sử dụng có hiệu quả và phát triển bền vững kinh tế biển khu vực vịnh.
- Về ứng dụng: Kết quả đề tài có thể được tham khảo và sử dụng trong công tác quản lý, quy hoạch phát triển kinh tế-xã hội vực nước vịnh Vũng Rô cũng như trong nghiên cứu, giảng dạy về lĩnh vực môi trường và đánh giá khả năng tự làm sạch vực nước. Đề tài đã xây dựng 3 phần mềm: 01 phần mềm quản lý cơ sở dữ liệu Vũng Rô, 01 phần mềm dự báo lan truyền vật chất trong vịnh Vũng Rô và 01 phần mềm tính toán sức tải vịnh Vũng Rô.

Một số hình ảnh của đề tài:

Cung cấp phương pháp luận và kết quả đánh giá khả năng tự làm sạch thủy vực nửa kín ven bờ.

- Các bài báo đã công bố: Đề tài đã công bố 02 bài báo trên tạp chí của Viện Hàn lâm KHCNVN, 01 bài trên tạp chí chuyên ngành trong nước, 01 bài trên Tuyển tập khoa học của Viện Hải dương học:
+  Nguyễn Hữu Huân và Nguyễn Trịnh Đức Hiệu, 2017. Năng suất sinh học sơ cấp của thực vật nổi và một số yếu tố sinh thái liên quan ở vực nước Vũng Rô (Phú Yên). Tạp chí sinh học. Tập 39. Số 1. 2017, trang: 40-50.
+ Trần Văn Chung và Nguyễn Hữu Huân, 2017. Tính toán dòng chảy tại vịnh Vũng Rô theo phương pháp phần tử hữu hạn. Tạp chí Khoa học và công nghệ biển. Tập 17. Số 2.2017, trang: 121-131.
+ Hoàng Trung Du, Nguyễn Hữu Huân, Võ Hải Thi, Lê Trọng Dũng, Lê Trần Dũng, Nguyễn Hữu Hải, 2015. Đánh giá hiện trạng và xem xét khả năng ảnh hưởng của hoạt động nuôi lồng bè đối với chất lượng môi trường trầm tích vịnh Vũng Rô, tỉnh Phú Yên. Tuyển Tập Nghiên Cứu Biển.Tập 21, số 1, trang: 84-93.
+ Nguyễn Thị Phương Thảo, Nguyễn Hữu Huân và Phan Minh Thụ, 2017. Đánh giá khả năng trao đổi nước và trạng thái dinh dưỡng vịnh Vũng Rô (Phú Yên). Tạp chí Khoa học - Công nghệ thủy sản. Số 2, trang: 87-95.
- Các sản phẩm cụ thể:  Đề tài có bộ sản phẩm gồm:
+ Báo cáo tổng kết;
+ Các báo cáo chuyên đề;
+ 03 phần mềm: Dự báo lan truyền vật chất; Quản lý cơ sở dữ liệu và Đánh giá sức tải môi trường.  
- Các sản phẩm khác: Thông qua thực hiện đề tài, đề tài đã hỗ trợ số liệu cho 01 học viên cao học bảo vệ thành công luận văn thạc sĩ.

Kết quả đề tài là nguồn tư liệu cho các cơ quan quản lý về thủy sản tại Phú Yên.