Thông tin Đề tài

Tên đề tài Nghiên cứu xác định và đánh giá các microRNA có tiềm năng nâng cao khả năng chống chịu mặn trên lúa (Oryza sativa L.) bằng phương pháp giải trình tự thế hệ mới
Mã số đề tài THTETN.04/21-23
Cơ quan chủ trì (Cơ quan thực hiện) Viện Nghiên cứu hệ gen
Thuộc Danh mục đề tài Khoa học sự sống
Họ và tên TS. Nguyễn Đức Quân
Thời gian thực hiện 01/06/2021 - 30/06/2023
Tổng kinh phí 500 triệu đồng
Xếp loại Chọn
Mục tiêu đề tài
- Xây dựng 8 bộ dữ liệu giải trình tự miRNA từ thân và rễ của 1 giống lúa chuẩn kháng và 1 giống lúa chuẩn nhiễm trong điều kiện bình thường và điều kiện nhiễm mặn bằng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới. 
- Xác định 2 miRNA tham gia kiểm soát tính trạng chống chịu mặn trên cây lúa.
- Xác định 1 nhóm các gen chịu mặn kiểm soát bởi 2 miRNA đã được phát hiện. 
Kết quả chính của đề tài
- Về khoa học:
+ Đề tài đã đánh giá khả năng chịu mặn của 2 giống lúa ĐP và IR28 ở giai đoạn mạ trong điều kiện nhiễm mặn 150 mM NaCl trong 5 ngày liên tiếp. Kết quả đánh giá các đặc điểm sinh lý và sinh hóa xác định rằng giống lúa ĐP sử dụng trong nghiên cứu là giống chuẩn kháng và giống IR28 là giống chuẩn nhiễm.
+ Đề tài đã giải trình tự miRNA từ thân và rễ của 2 giống lúa ĐP và IR28, và thu được 8 bộ dữ liệu, bao gồm ĐP-ĐC-T, ĐP-ĐC-R, ĐP-NaCl-T, ĐP-NaCl-R, IR28-ĐC-T, IR28-ĐC-R, IR28-NaCl-T và IR28-NaCl-R, có chất lượng tốt. Chỉ số chất lượng giải trình tự toàn bộ miRNA: Q20 > 90% và Q30 > 80%.
+ Qua quá trình sàng lọc và phân tích tin sinh, đề tài đã xác định 4 miRNA tiềm năng tham gia vào quá trình chịu mặn trên cây lúa ĐP, bao gồm miR164d, miR168a, miR171h và miR398a. Đây là những miRNA tiềm năng tham gia vào quá trình thích ứng mặn trên cây lúa, thông qua việc can thiệp vào quá trình kiểm soát biểu hiện các gen đích là SPL tham gia vào điều hóa quá trình sinh tổng hợp anthocyanin có tác dụng chất chống lại các gốc oxy hóa tự do, yếu tố phiên mã NAC21/22, protein kiểm soát biểu hiện gen và tăng trưởng AGO1, và SCL6-II tham gia kiểm soát quá trình phát triển của hệ rễ trong cây lúa ĐP bị nhiễm mặn.
+ Đề tài đã đánh giá độ chính xác của 8 bộ dữ liệu giải trình tự miRNA bằng phương pháp RT-qPCR. Phân tích kết quả RT-qPCR của 4 miRNA, miR164d, miR169i, miR172d, miR398a, cho thấy rằng biểu hiện của chúng có độ tương đồng cao với kết quả giải trình tự miRNA trên 2 giống lúa ĐP và IR28 trong điều kiện nhiễm mặn. Kết quả RT-qPCR cũng cho thấy những miRNA có tiềm năng kiểm soát biểu hiện các gen đích của chúng là NAC21/22, NTYF, AP2/ERF và CSD2. Điều đó chứng minh rằng bộ dữ liệu giải trình tự miRNA thu được là chuẩn xác và có độ tin cậy cao.
- Về ứng dụng: Kết quả thu được từ nghiên cứu này làm sáng tỏ hơn cơ chế chống chịu mặn của cây lúa nói chung và trên giống lúa chuẩn kháng Đốc Phụng ở cấp độ phân tử. Bên cạnh đó, các bộ dữ liệu miRNA cũng cung cấp một công cụ tiềm năng hỗ trợ rút ngắn thời gian nghiên cứu và phát triển các giống lúa chịu mặn mới có khả năng chống chịu mặn cao.
Những đóng góp mới

- Đề tài đã xác định được 4 miRNA tiềm năng tham gia vào quá trình chống chịu mặn trên cây lúa Đốc Phụng.

Ảnh nổi bật đề tài
1703231712116-Screen Shot 2023-12-22 at 2.54.24 PM.png